Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCO1Q9UM00 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO1Q9UM00 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCO1Q9UM00 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms