Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNOT6Q9ULM6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT6Q9ULM6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT6Q9ULM6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms