Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP45Q9UL16 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFAP45Q9UL16 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP45Q9UL16 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms