Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJD2Q9UKL4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GJD2Q9UKL4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJD2Q9UKL4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms