Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMEB2Q9UKD1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMEB2Q9UKD1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GMEB2Q9UKD1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMEB2Q9UKD1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms