Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED13Q9UHV7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED13Q9UHV7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MED13Q9UHV7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms