Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN4Q9UHM6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OPN4Q9UHM6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms