Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAJB9Q9UBS3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJB9Q9UBS3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms