Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DKK3Q9UBP4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DKK3Q9UBP4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DKK3Q9UBP4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms