Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MED11Q9P086 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED11Q9P086 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms