Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PKD2L2Q9NZM6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2L2Q9NZM6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2L2Q9NZM6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms