Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCNIP1Q9NZI2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP1Q9NZI2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms