Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLGN3Q9NZ94 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLGN3Q9NZ94 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms