Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DLL3Q9NYJ7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DLL3Q9NYJ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DLL3Q9NYJ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms