Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSD3Q9NYI0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSD3Q9NYI0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms