Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALKBH4Q9NXW9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALKBH4Q9NXW9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms