Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDE1Q9NXR1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDE1Q9NXR1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDE1Q9NXR1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms