Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A12Q9NXJ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A12Q9NXJ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A12Q9NXJ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms