Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATAD3AQ9NVI7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATAD3AQ9NVI7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATAD3AQ9NVI7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms