Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJC11Q9NVH1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC11Q9NVH1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC11Q9NVH1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms