Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TCP11L1Q9NUJ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCP11L1Q9NUJ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms