Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCM2LQ9NUG4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCM2LQ9NUG4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms