Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKDREJQ9NTG1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKDREJQ9NTG1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms