Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD18Q9NS91 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD18Q9NS91 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms