Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DUOX1Q9NRD9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DUOX1Q9NRD9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUOX1Q9NRD9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms