Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.18
DUOX2Q9NRD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
DUOX2Q9NRD8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DUOX2Q9NRD8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms