Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FBXO6Q9NRD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO6Q9NRD1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO6Q9NRD1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms