Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST12Q9NRB3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHST12Q9NRB3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms