Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms