Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FANCFQ9NPI8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FANCFQ9NPI8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FANCFQ9NPI8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCFQ9NPI8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCFQ9NPI8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCFQ9NPI8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCFQ9NPI8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCFQ9NPI8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCFQ9NPI8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FANCFQ9NPI8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms