Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUFT1Q9NNX1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TUFT1Q9NNX1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUFT1Q9NNX1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms