Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPRHQ9HD43 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRHQ9HD43 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRHQ9HD43 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
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