Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XAB2Q9HCS7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XAB2Q9HCS7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XAB2Q9HCS7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms