Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KIAA1549Q9HCM3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KIAA1549Q9HCM3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KIAA1549Q9HCM3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms