Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC4Q9HBW1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC4Q9HBW1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC4Q9HBW1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms