Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EBF2Q9HAK2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EBF2Q9HAK2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms