Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAC7

SUGCT, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGCTQ9HAC7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SUGCTQ9HAC7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUGCTQ9HAC7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUGCTQ9HAC7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms