Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP13A3Q9H7F0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A3Q9H7F0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms