Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPF2Q9H7B2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPF2Q9H7B2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPF2Q9H7B2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms