Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BCAS3Q9H6U6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BCAS3Q9H6U6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BCAS3Q9H6U6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms