Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHX3Q9H6B9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHX3Q9H6B9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.5 ms