Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIF1Q9H611 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIF1Q9H611 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms