Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RWDD1Q9H446 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RWDD1Q9H446 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RWDD1Q9H446 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms