Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDCL3Q9H2J4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms