Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRMDAQ9H2I8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms