Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GANQ9H2C0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GANQ9H2C0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GANQ9H2C0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms