Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VPS16Q9H269 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
VPS16Q9H269 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS16Q9H269 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms