Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDT1Q9H211 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDT1Q9H211 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms