Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP1Q9GZU7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTDSP1Q9GZU7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms