Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NYXQ9GZU5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NYXQ9GZU5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NYXQ9GZU5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms